Не только пцр. какие бывают тесты на коронавирус и чем они отличаются

Классификация SARS-CoV-2

Активные исследования продолжаются, однако, на 27 января достоверно известны 26 генома SARS-CoV-2, а в марте их число увеличилось до 103.

В целом, уханьский коронавирус склонен к мутированию. Так, ученые выявили склонность SARS-CoV-2 к эволюционированию, поэтому, на март уже обнаружено 149 изменений в его штамме. Кроме того, новый коронавирус разделили на 2 подтипа — «L» и «S». Подтип «L» являлся первоначальной формой SARS-CoV-2, обнаруженной в Ухане, и его доля у больных составляет до 70%. Подтип «S» появился позже, является менее агрессивен и встречается примерно в 30% больных.

Штаммы коронавируса SARS-CoV-2

Наиболее популярными штамами являются:

«VUI-202012/01» — новый штамм коронавируса из Великобритании, или как его еще называют новый «Британский штамм», вызывающий COVID-19. Согласно последним данным, является на 70% более заразным, по сравнению с обычным, распространенным по всему миру штамом, терзающий людей с конца 2019 года

У «Британского коронавируса» выявлено 17 мутаций, но наиболее важной, которая и вызывает большую активность по проникновению в клетку «жертвы» является мутация N501Y в белке-шипе, использующийся для связывания в рецептором ACE2 человека. Именно из-за высокой заразности VUI-202012/01 на данный момент очень быстро вытесняет другие штаммы

Тем не менее, как заявляют вирусологи, против VUI-202012/01 вакцина будет также действенной.

Что делать, если вирусный тест положительный?

Если получен положительный результат, должны быть приняты следующие профилактические меры:

• Оставайтесь дома, если вам не нужна медицинская помощь.
• Оставайтесь на связи с врачом и следите за симптомами. Если симптомы ухудшаются, обратитесь к врачу.
• В случае проблем с дыханием или при наличии других серьезных симптомов, немедленно обратитесь за медицинской помощью.
• Избегайте контакта с другими членами семьи. Если возможно, используйте отдельную ванную комнату.
• При кашле или чихании прикрывайте рот и нос платком или локтем. Часто и тщательно мойте руки с мылом и водой.
• Часто чистите и дезинфицируйте помещения и поверхности дома. Помещения, в которых находится изолированный человек, следует убирать каждый день.

Where can I get my COVID-19 test result?

As soon as the result of your COVID-19 test is available, you will find it via the portal .

• Log into the portal, select “COVID-19” and click on “My COVID-19 Test Result” or one of the links below.
• Providing a mobile phone number during the sampling allows you, in some cases, to receive the result immediately and very easily via a secure text message.
• If you use the Coronalert application and you have generated and entered the 17-digit code, you can receive your result via this application.
• If you cannot access or do not have the Coronalert application (no ID card, no PC/mobile phone or internet connection), please contact your GP.

If you do not have a regular GP, or if he/she is not available, please be advised that all doctors can consult the results of the tests, as long as:

• the doctor has your national register number
• the doctor has a therapeutic relationship with you
• your informed consent has been given for the sharing your health data (on the portal > “Access Management”).

На антиген-тесты возлагают надежды

«Мы считаем, что у тестов на антиген самый высокий потенциал для скрининга бессимптомных людей», — считает Мара Аспинолл (Mara Aspinall), создатель программы биомедицинской диагностики в Университете штата Аризона. Она сообщила JAMA, что сейчас два десятка компаний работают над простым и быстрым тестом на SARS-CoV-2, который по простоте можно будет сравнить с тестом на беременность.

«Мы берем современную лабораторию и сжимаем ее до размера покрытой пластиком полоски», — сказал JAMA Бобби Брук (Bobby Brooke) основатель E25Bio, одной из компаний, которые принимают участие в гонке за простым тестом.

В нашем центре проводится два вида тестирования:

Экспресс-тест на выявление РНК коронавируса COVID-19 (SARS-CoV-2) методом ИХА

Выявление РНК коронавируса COVID-19 (SARS-CoV-2) методом ПЦР

Обследование на коронавирусную инфекцию (COVID-19), с выдачей сертификата международного образца на английском языкеАнализ на новую коронавирусную инфекцию для сотрудников предприятий

Обращаем внимание! Скидки на услуги не распространяются. При получении положительного или сомнительного результата на COVID-19, лаборатория в соответствии с требованием Роспотребнадзора, в течение 2-х часов направляет биоматериал на повторное исследование ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

В связи с этим срок проведения обследования может быть увеличен до 7-8 дней

При получении положительного или сомнительного результата на COVID-19, лаборатория в соответствии с требованием Роспотребнадзора, в течение 2-х часов направляет биоматериал на повторное исследование ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. В связи с этим срок проведения обследования может быть увеличен до 7-8 дней.

Важно!

Необходима предварительная запись через форму на сайте или по телефону: + 7 (495) 280-82-00

При себе обязательно необходимо иметь паспорт! При отсутствии паспорта исследование не проводится.

Подготовка к анализу

• взятие биоматериала осуществляется натощак или не ранее, чем через 2 часа после приема пищи и питья; до проведения гигиенических процедур, полоскания, орошений и лекарственными средствами;
• исследование рекомендуется проводить до начала противовирусного лечения;
• за 24 часа до взятия материала не рекомендуется применение всех видов местных форм лекарственных препаратов.

Подробнее об анализе.
Уважаемые пациенты!
Если Вы не получили результат анализа на электронную почту, направьте, пожалуйста, запрос на covid@scz.ru, либо уточните по телефону 
 +7 (495) 280-82-00, доб. 979 (с 8:00 до 17:00)
В запросе необходимо указать ФИО пациента, дату рождения, адрес электронной почты для направления анализа.

Зачем сдавать тест на коронавирус, если я здоров?

Обезопасить себя и своих близких! В течение 14 дней с момента заражения вирус может не проявлять себя, но в тоже время носитель может быть опасен для окружающих. Прохождение теста дает уверенность в отсутствии вируса в организме на данный момент.

Опасно ли нахождение в медицинском центре при сдаче анализа?

Мы принимаем все необходимые меры для обеспечения эпидемиологической безопасности:

• прием пациентов для анализа на Covid-19 проводится в специально оборудованном отдельно стоящем здании;
• на входе в здание всем сотрудникам и пациентам измеряют температуру, проводят обработку рук антисептическим гелем, выдают маски;
• тест проводится только у пациентов без признаков ОРВИ;
• все специалисты, работающие с пациентами, пришедшими на сдачу анализа, ведут прием в средствах индивидуальной защиты;
• проводится постоянное очищение поверхностей дезинфицирующими средствами и дезинфекция воздуха с помощью бактерицидных ультрафиолетовых установок;
• после каждой сдачи анализа в помещении проводится дезинфекция.

Могу ли я заразиться по пути в центр или обратно?

Сотрудники общественного транспорта принимают все необходимые меры по обеспечению безопасности пассажиров.

Дополнительно каждый должен соблюдать меры профилактики, в их числе:

• соблюдать дистанцию от других пассажиров не менее 1,5 метров;
• минимизировать прикосновения к поверхностям в транспорте;
• правильно использовать индивидуальные средства защиты (маски, перчатки);
• в дороге использовать дезинфицирующие средства для рук;
• избегать прикосновений рук к лицу, глазам, носу.

 Оплатить услугу онлайн 

Информация о COVID-19

COVID-19 – это название инфекции и заболевания, вызванного новым штаммом коронавируса под названием SARS-CoV-2. Один тип теста COVID-19 может обнаружить генетический материал (РНК) вируса в пробе, взятой из дыхательных путей. Серологический тест COVID-19 обнаруживает антитела, вырабатываемые в ответ на инфекцию. В свою очередь, тест на антиген COVID-19 позволяет обнаружить вирусные белки в образцах из дыхательных путей, но этот тест пока еще малодоступен.

SARS-CoV-2 – это новый вирус, который появился в декабре 2019 года и распространился по всему миру с огромной скоростью, в результате чего Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) объявила о пандемии. Поскольку пандемия продолжается, ученые исследуют вирус и расширяют свои знания об инфекции COVID-19.

Есть семь типов коронавирусов, которые заражают людей. Большинство из них вызывают легкие или умеренные респираторные симптомы, но инфекция SARS-CoV-2 похожа на MERS (ближневосточный респираторный дистресс-синдром) и SARS (острый тяжелый респираторный дистресс-синдром), поскольку она может быть более тяжелой и в некоторых случаях приводить к тяжелому воспалению легких и даже смерти.

SARS-CoV-2 – это новый вирус, поэтому каждый человек потенциально подвержен заражению, и в настоящее время неизвестно, в каких случаях возникают серьезные осложнения. В отличие от сезонного гриппа, который также может быть тяжелым и смертельным, в настоящее время прививок или специфических методов лечения SARS-CoV-2 пока нет.

Примерно через 1-2 недели после заражения организм начинает вырабатывать антитела против вируса, и их уровни постепенно увеличиваются со временем. Однако пока не известно, как долго длится их производство и обеспечивают ли они иммунитет, защищая от повторного заражения.

В некоторых случаях инфекция может протекать бессимптомно или симптомы могут быть незначительными, но больной все равно может заразить других людей («тихий носитель»). По предварительным данным, в 80% случаев симптомы отсутствуют или они носят умеренный или легкий характер, и зараженный человек выздоравливает в течение 1-2 недель. 

Симптомы COVID-19 обычно появляются через 2-14 дней после контакта с вирусом. Исследования, проведенные на сегодняшний день, показывают, что среднее время от подверженности развитию заболевания (инкубационный период) составляет около 5 дней, и у 97% тех, у кого появились симптомы, заражение и развитие симптомов произошло в течение 11 дней.

Основные симптомы, связанные с COVID-19:

• кашель;
• одышка;
• проблемы с дыханием. 

Также больной может испытывать жар, озноб, судороги с ознобом, мышечные боли, головную боль, боль в горле и потерю обоняния или вкуса. Симптомы могут появляться периодически, и иногда пациент может чувствовать себя лучше. У детей и младенцев заболевание обычно протекает легче.

Риск тяжелой инфекции увеличивается с возрастом и наличием сопутствующих заболеваний, таких как болезни сердца, заболевания легких, гипертонии, диабета или нарушения иммунной системы. У некоторых пациентов развивается пневмония, и в наиболее тяжелых случаях необходимо специальное оборудование для обеспечения адекватного снабжения организма кислородом. 

В крайних случаях COVID-19 может привести к повреждению органов и даже смерти.

Откуда берутся ложные результаты ПЦР на ковид

С весны 2020 года в СМИ и интернете муссируется тема немалого количества ложноотрицательных и ложноположительных результатов тестов на ковид. По словам главного внештатного пульмонолога Минздрава России Сергея Авдеева, которые цитирует РБК, до 30-40% тестов ПЦР могут давать ложные результаты. Так называют отрицательный результат ПЦР при наличии у пациента выраженных симптомов COVID-19 и изменений на КТ. Или наоборот — человек болеет ОРВИ, а тест показывает, что он заражен коронавирусом.

При этом с 13 ноября 2020 года Роспотребназдор отменил обязательную сдачу теста на COVID-19 у тех людей, которые контактировали с зараженным. Они могут покинуть 14-дневную самоизоляцию без проведения теста. Это довольно сильно напугало многих людей, которые опасаются заболеть коронавирусом при случайном контакте с прохожими, покупателями в магазинах и т.д. Так что вопрос ложных результатов ПЦР остается по-прежнему острым.

Одной из причин ложноотрицательных и ложноположительных результатов стала низкая чувствительность некоторых тестов, которые использовались весной, когда спешно разрабатывались методики быстрого выявления коронавирусной инфекции. Сейчас тесты стали более чувствительными, однако есть и другие причины недостоверных результатов.

Дело в том, что РНК COVID-19 довольно нестойкая и быстро разрушается под воздействием внешней среды. А потому точность анализа очень сильно зависит от правильного взятия, хранения и перевозки биоматериала, его достаточного количества. Если нарушать правила забора мазков или взять недостаточно материала для исследования, то ПЦР может дать ложный результат.

Наконец, ПЦР на более поздних стадиях болезни тоже может выдать отрицательный результат, т.к. вирус уже погиб под влияем лекарств или скрылся, а воспалительный процесс тем не менее идет.

Почему ПЦР-тест пока не спас мир

В настоящее время ПЦР-тесты остаются самыми чувствительными к коронавирусу. В Южной Корее и Новой Зеландии их широкое применение помогло подавить инфекцию, указывает автор публикации в Nature. Однако этот успех не удалось повторить в других странах. Согласно той же статье, в США не удалось добиться их эффективного использования из-за плохой координации, партий некачественных тестов и сложностей с поставками.

Оперативность ПЦР-теста невелика, в лучшем случае он займет несколько часов, в реальной жизни в случае плохого сценария результаты можно ожидать несколько дней. Гипотетически, человек, у которого реакция ПЦР не обнаружила коронавирус, может быть уже инфицированным на момент получения результата анализа. Проведение анализа требует специальной лаборатории и обученных специалистов, то есть, он ресурсоёмкий.

Затрудняет массовое тестирование и сравнительно высокая цена теста. В Москве его проведение на дому может стоить более 5000 рублей.

Настройки противовирусной защиты

Гепатит, как отмечают ученые, не взаимодействует с ACE2 напрямую, однако после развития инфекции уровень активности этого рецептора меняется, так как он связан со многими компонентами врожденной иммунной системы клеток. Руководствуясь подобной идеей, биологи проследили за тем, как менялось поведение молекул ACE2 в клетках двух сотен кусочков живой ткани, которую извлекли из печени носителей гепатита C.

Эти изменения биологи сопоставили с тем, как различались наборы мелких мутаций в геномах этих клеток, а также с тем, как изменилась концентрация других белков, потенциально связанных и с ACE2, и с врожденным иммунитетом. Этот анализ указал на то, что различия в активности «пособника» SARS-CoV-2 были в первую очередь связаны с двумя генами врожденной иммунной системы, IFNL3 и IFNL4.

В свою очередь, их поведение зависело от того, как был устроен другой участок ДНК, который расположен на 19-й хромосоме человека. В этом сегменте генома, который биологи назвали «регионом IFNL», может находиться три разных типа мутаций. Они значительно меняют то, как организм реагирует на проникновение любого типа вируса в организм.

«Крайне важно узнать, как вариации в регионе IFNL влияют на развитие инфекции в реальных тканях легких. Это особенно важно в контексте того, что мутации в этой части генома встречаются с неодинаковой частотой среди представителей разных этнических групп, что может влиять на характер распространения COVID-19 и смертность от вируса», – пишут ученые

Одна из них значительно понижала количество молекул ACE2, которые вырабатываются в ответ на проникновение вирусов в клетки печени, тогда как две других не препятствовали этому. Это было связано с тем, что обе этих «опечатки» в ДНК приводили к тому, что ген IFNL4 полностью отключался и не участвовал в борьбе с вирусной инфекцией.

Что интересно, степень различий в уровне активности ACE2, которая связана с мутациями в участке IFNL, наиболее ярко проявлялась среди молодых людей и почти не влияла на концентрацию этого белка в клетках пожилых больных. Это, как считают исследователи, может частично объяснять то, почему некоторые молодые люди умирают от COVID-19, тогда как другие переносят болезнь почти без симптомов.

Подобные генетические различия, как считают авторы статьи, нужно учитывать при лечении отдельных пациентов, а их распространенность по всей популяции следует принимать в расчет при прогнозировании хода коронавирусной инфекции.

Следует добавить, что статью ученых не рецензировали независимые эксперты и редакторы научных журналов, как это обычно бывает в подобных случаях

Поэтому к выводам из нее и аналогичных статей следует относиться осторожно

Анализы на COVID-19

Обычно первые симптомы COVID-19 не отличаются от обычной простуды или инфекции верхних дыхательных путей, поэтому для определения текущей или прошлой болезни необходимы тесты.

• Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР). Большинство тестов на наличие активной инфекции SARS-CoV-2 основаны на методе ОТ-ПЦР, который позволяет обнаруживать вирусную РНК в образце, взятом из дыхательной системы пациента. ПЦР – это лабораторный метод, используемый для получения нескольких копий коротких фрагментов ДНК из очень маленького образца ДНК, чтобы их можно было обнаружить. Этот процесс называется амплификацией. Этап обратной транскрипции позволяет вирусной РНК превращаться в ДНК, чтобы затем можно было использовать метод ПЦР.
• Анализ крови на антитела (общий, IgG, IgM) против SARS-CoV-2 (серологический тест). Обнаружено присутствие антител, продуцируемых иммунной системой организма в ответ на SARS-CoV-2. Серологические тесты на COVID-19 позволяют подтвердить предыдущую инфекцию, однако тест на антитела не является предпочтительным методом выявления активной инфекции. Антитела появляются не раньше, чем через 1-2 недели после заражения, поэтому их нельзя обнаружить на ранних стадиях заболевания. 

Также были разработаны экспресс-тесты на наличие антител. Тестируется кровь из пальца. 

И «Арбидол» не принимать

С вопросом о том, как осуществляется забор биоматериала для ПЦР-тестов в государственных медучреждениях, как инструктируют пациентов и медработников, осуществляющих забор, «Реальное время» обратилось в пресс-службу татарстанского Минздрава. Ответ по получении будет опубликован.

Гендиректор лечебно-диагностического центра «Биомед» Римма Гизатуллина рассказала, как это происходит в учреждении, которым она руководит:

— У нас есть специальные требования, которые мы выполняем. И первое — мы производим забор биоматериала только у тех, у кого нет признаков ОРВИ и повышенной температуры. Тот, кто реально болеет, сдает тест в государственном медучреждении. Кроме того, за 7—10 дней до сдачи биоматериала пациент не должен принимать противовирусные препараты. Ведь очень часто бывает, что люди несколько дней капают себе в нос «Гриппферон» или «Арбидол» пьют, а потом на третий-четвертый день идут сдавать. Мы не можем проверить, верим на слово, если говорят: «Я ничего не пил». Но чтобы обеспечить достоверность, это правило надо соблюдать.

Нельзя, по словам Гизатуллиной, накануне сдачи теста использовать средства от першения и боли в горле, средства для освежения полости рта. После употребления таких «сосалок-фыркалок» анализ не покажет истинную картину. И за три-четыре часа до исследования нельзя ни есть, ни чай и кофе пить:

— При этом из слизистой вымывается то, что мы ищем.

— А зубы утром чистить тоже нельзя? — уточнила корреспондент издания.

— Поскольку мы берем мазки после 14.00, чистить зубы с утра можно. За это время на слизистой все равно появится какая-то среда.

А еще, подтвердила гендиректор «Биомеда», многое зависит от квалификации сотрудника, осуществляющего забор материала:

— Прежде чем дать добро на эти манипуляции нашим медсестрам, их обучает главный врач, с видеофильмами — от того, как надеть защитный костюм, до того, как упаковать биоматериал. От этого тоже зависит очень многое. От того, как биоматериал взяли — просто погладили или отобрали, как положено. Например, должна быть тройная упаковка, используются хладоэлементы. Это требования преаналитики — если что-то будет нарушено, результаты получатся недостоверными.

Результаты анализа зависят даже от количества отобранного биоматериала, добавила Римма Гизатуллина.

Спрос вырос за счет возвращающихся из Турции отпускников и за счет тех, кто переболел ОРВИ. Фото Ильи Репина

Клиника воспаления

Клиника пневмонии при коронавирусной инфекции чаще всего появляется на 3-5 день после заражения. Симптомы воспаления легких при COVID-19 носят несколько смазанный характер. Это обусловлено тем, что вирусы, как правило, вызывают атипичную пневмонию. При этом на первый план выходит общая симптоматика:

• высокая температура (38оС и выше);
• головные боли;
• боль в мышцах;
• выраженная слабость и повышенная утомляемость;
• озноб.

Вместе с тем присутствуют симптомы поражения верхних дыхательных путей и легких:

• насморк;
• першение и боли в горле;
• охриплость (осиплость) голоса;
• выраженный кашель с отделением мокроты;
• одышка.

Одышка является основным симптомом пневмонии. В начале заболевания она проявляется только при физической работе (подъем по лестнице, длительная ходьба, занятия спортом и др.). Поэтому для людей с малоактивным образом жизни она может остаться незаметной. Но, как правило, все же одышка прогрессирует и заставляет больного обратиться к врачу.

В стадии разгара все клинические проявления достигают максимальной выраженности (чаще всего к концу первой недели). При пневмонии средней степени тяжести симптомы выражены умеренно, одышка возникает только при нагрузке (если болезнь не отягощена сопутствующей патологией).

При тяжелых формах коронавирусной пневмонии инкубационный период короткий (1-3 дня), симптомы появляются рано и быстро нарастают. Одышка присутствует даже в покое. Больной занимает вынужденное положение (ортопноэ), спать может только сидя.

Данное состояние развивается в течение 7-8 суток, затем развиваются осложнения:

• острый респираторный дистресс-синдром (РДС);
• острая дыхательная недостаточность;
• острая сердечно-сосудистая недостаточность.

При развитии осложнений пациент переводится в отделение реанимации, где ему проводят искусственную вентиляцию легких.

Осложнения коронавирусной инфекции