Варианты и виды коронавируса, с которыми можно столкнуться

Портрет убийцы

«Первый вопрос всегда – что это такое?» – говорит профессор-иммунолог Кристиан Андерсен.

Лаборатория Андерсена специализируется на геномике инфекционных заболеваний. Они изучают распространение вирусов с животных на людей.

Как и треть населения планеты, профессор Кристиан Андерсен живет и работает в изоляции

Как и треть населения планеты, профессор Кристиан Андерсен живет и работает в изоляции

Еще в конце декабря, буквально через несколько часов после госпитализации первых пациентов, ученые из Института вирусологии Уханя уже анализировали носовые мазки заболевших таинственным вирусом.

Грязная еда

И SARS-CoV-1, и новый SARS-CoV-2 начали свой путь с рынков дичи, открытых торговых площадок, где продают диких и домашних животных, предназначенных для употребления в пищу. Экзотическую живность, включая летучих мышей, панголинов, змей и черепах, используют для традиционной китайской кухни е-вэй.

Один из таких рынков, находящихся в южнокитайской провинции Гуандун, в 2002 году стал местом рождения возбудителя атипичной пневмонии, или SARS (тяжелый острый респираторный синдром). На тот момент человечеству повезло — коронавирус не стал причиной пандемии (отчасти из-за того, что был слишком опасен для зараженных).

Природные носители вируса SARS — подковоносые летучие мыши, обитающие в лесах Гуандуна. На рынке коронавирус легко перекинулся на других продававшихся рядом животных, включая пальмовых циветт. Размножаясь внутри них, вирус постоянно мутировал. Появление мутантной формы, способной поражать людей, было вопросом времени и произошло в ноябре 2002 года.

Фото: Wikipedia

Любой коронавирус, даже самый безобидный, нацелен на слизистую оболочку дыхательных путей. Именно коронавирусы вызывают многие респираторные вирусные заболевания, которые не сильнее обычной простуды.

Однако вызвавший 20 лет назад серьезную вспышку SARS-CoV-1 был другим: он влиял на человеческую иммунную систему, в результате чего болезнь, похожая на ОРЗ, вдруг превращалась в смертельно опасную пневмонию, при которой легкие заполнялись жидкостью, вызывая дыхательную недостаточность. На простуду SARS не был похож, поскольку не вызывал чихание и насморк, а начинался с лихорадки, озноба и общего недомогания, а спустя какое-то время появлялся сухой кашель.

Атипичная вирусная пневмония поразила восемь тысяч человек, при этом умер почти каждый десятый. Среди людей старше 50 лет смертность достигала более 50 процентов. Впрочем, исключительная опасность коронавируса сыграла против него: патоген убивал чересчур быстро и просто не успевал распространиться. После 2004 года не было зарегистрировано ни одного случая заражения SARS-CoV-1.

Классификация и характеристики

Вирион коронавирусов (Coronaviridae) имеет шарообразную форму, диаметр которой составляет 120-160 нм. Внешне вирион покрыт липидной (жировой) оболочкой. На липидной оболочке размещены вытянутые булавовидные пепломеры (5-10 нм в длину), напоминающие пики королевской короны, что и поспособствовало именованию – «коронавирус». У Beta¬coronavirus (бетакоронавирусов) на поверхности дополнительно присутствует гемагглютинин-эстераза (НЕ) – поверхностный гликопротеин (gp). Белок М вириона – трансмембранный. Нуклеокапсид сформированный фосфорилированным белком N выполнен в виде спиральной симметрии размером 60-70 нм.

Инфицирование Coronaviridae приводит к появлению высокотитражных антимикробных сывороток, размещенных на S- , N- , M- и HE-антигенах. Наиболее высокоактивные антимикробные эпитопы, на которых размещены нейтрализующие антитела – белки S- и HE, с меньшей эффективностью — М- и N- , однако, для достижения лучшей иммунизации и защиты организма используется комбинация S- и N-белков.

Coronaviridae является лидером и по размерам геномов РНК – от 26 000 до 32 000 н.о., причем, BWCoV SW1 (коронавирус белух SW1), относящийся к Gammacoronavirus имеет крупнейший размер РНК — 31 686 н.о.

ВИРУСОЛОГИЯ

Семейство коронавирусов относятся к порядку Nidovirales. Репликация коронавирусов происходит с использованием мРНК (матричная рибонуклеиновая кислота; синоним — информационна РНК, иРНК). Далее коронавирусы делятся на два подсемейства – Coronavirinae и Torovirinae.  Подсемейство Coronavirinae имеет четыре рода: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, Deltacoronavirus; подсемейство Torovirinae имеет два рода: Torovirus и Bafinivirus.

Коронавирусы человека (HCoVs) относятся к двум родам: Alphacoronavirus (HCoV-229E и HCoV-NL63) и Betacoronavirus (HCoV-HKU1, HCoV-OC43, MERS-CoV, SARS-CoV, SARS-CoV-2).

Рекомбинационный анализ

В результате своего уникального случайного переключения матриц во время репликации РНК, который, как считается, опосредуется механизмом «выбора копии», коронавирусы имеют высокую частоту гомологичной рекомбинации РНК.

Впервые рекомбинация в коронавирусах была выявлена между различными штаммами MHV и впоследствии в других коронавирусах, таких как IBV, между MHV и BCoV, а также между кошачьим коронавирусом (FCoV) I типа и коронавирусом собак (CCoV). Как показано ниже, такая рекомбинация может приводить к образованию видов коронавирусов или различных генотипов внутри видов коронавирусов. По общему мнению, возможность гомологичной рекомбинации РНК и возможную часть генома, в которой произошла рекомбинация, обычно сначала оценивают с использованием бутсканированного анализа или филогенетического анализа с использованием различных частей генома коронавируса.

Другие методы для рекомбинационного анализа, такие как те в пакете RDP3, также доступны. Тогда точный тип гомологичной рекомбинации РНК лучше всего будет выявлен путем множественного выравнивания последовательностей.

Лучшим документированным примером генерации видов коронавирусов посредством гомологичной рекомбинации РНК является генерация FCoV типа II путем двойной рекомбинации между FCoV типа I и CCoV. Впервые было отмечено, что последовательность белка S в FCoV типа II была тесно связана с последовательностью CCoV, но последовательность ниже по течению от гена E в FCoV типа II была более тесно связана с последовательностью штамма FCoV типа I чем в CCoV. Это наблюдение предположило, что, возможно, произошел гомологичный случай рекомбинации РНК между геномами CCoV и FCoV типа I, что привело к генерации FCoV типа II.

Дальнейший анализ путем множественного выравнивания последовательностей выявил сайт рекомбинации в области в гене E. Несколько лет спустя была обнаружена дополнительная область рекомбинации в гене Pol, и был сделан вывод, что FCoV типа II возник в результате двух событий рекомбинации между геномами CCoV и FCoV типа I.

Что касается генерации различных генотипов у видов коронавирусов посредством гомологичной рекомбинации РНК, лучшим документально подтвержденным примером является HCoV-HKU1. Возможность гомологичной рекомбинации РНК впервые была заподозрена, когда несколько штаммов HCoV-HKU1 продемонстрировали дифференциальную кластеризацию, когда гены Pol, S и N были использованы для построения филогенетического дерева. Это наблюдение привело к последующему исследованию полного секвенирования генома 22 штаммов HCoV-HKU1.

Рекомбинационный анализ методом бутскана и филогенетический анализ с использованием различных частей 22 полных геномов выявил обширную рекомбинацию в различных частях геномов, что привело к образованию трех генотипов, A, B и C, HCoV-HKU1. Используя множественное выравнивание последовательностей, были точно определены два сайта рекомбинации.

Первый наблюдался на участке из 143 нуклеотидов около 3′-конца nsp6, где рекомбинация между генотипом B HCoV-HKU1 и генотипом C породила генотип A и второй в другом участке из 29 нуклеотидов около 3′-конца nsp16, где рекомбинация между генотипом A HCoV-HKU1 и генотипом B породила генотип C.

После эпидемии атипичной пневмонии отмечается заметное увеличение числа обнаруженных коронавирусов и секвенирование геномов коронавирусов. Это увеличение количества видов и геномов коронавирусов, всеобъемлющей и удобной для пользователя базы данных для эффективного поиска последовательностей и постоянно совершенствующихся инструментов биоинформатики позволило исследователям проводить значимый геномный, филогенетический, эволюционный уровень и расхождение, рекомбинацию и другие биоинформатические анализы на семействе Коронавирид.

Три разновидности (рода) коронавирусов: альфа-коронавирус , бета-коронавирус и гамма-коронавирус, были использованы для замены традиционных коронавирусов группы 1, 2 и 3. Вероятно, появится четвертый род, Deltacoronavirus, который включает BuCoV HKU11, ThCoV HKU12 и MunCoV HKU13. В соответствии с этой новой системой классификации коронавирусы летучих мышей доминируют над родами альфа-коронавируса и бета-коронавируса, а коронавирусы птиц доминируют над родами гамма-коронавируса и дельтакоронавируса. Это огромное разнообразие коронавирусов у летучих мышей и птиц сделало их превосходными генофондами для коронавирусов этих четырех родов.

Чем так опасен коронавирус в виде короны для людей

Новый вирус в виде солнечной короны проявил необычные свойства и стал очень опасен для людей, так как:

• вирус быстро распространяется;
• человек заразен в бессимптомной стадии, он продолжает активные контакты с окружающими и передает вирус;
• длительный инкубационный период после заражения (до 14 дней, но есть случаи и более 1 месяца) затрудняет поиск контактных лиц;
• многие не знают о болезни или переносят ее в форме легкой простуды, что не вызывает настороженности;
• заражение пожилых людей или имеющих сопутствующие болезни приводит к развитию у них тяжелой формы воспаления легких с дыхательной недостаточностью, высоким риском смертельного исхода;
• новый коронавирус подавляет иммунный ответ после проникновения в организм, что помогает ему быстро распространяться по дыхательным путям и проникать в легкие;
• вирусная пневмония двустороння, нередко охватывает больше 50% их ткани, ее находят, по последним данным, у 92% заболевших, в том числе и в легкой форме, без температуры;
• при попытке справиться с коронавирусом в легкие переходит большое количество иммунных клеток, при их разрушении выделяются цитокины, они вызывают отек легких (цитокиновый шторм);
• у ослабленных больных коронавирус открывает путь для заражения бактериями, это опасно переходом инфекции в кровеносное русло (сепсис, септический шок);
• последствием воспаления легких становится разрастание рубцовой ткани – фиброз, снижающий возможность насыщения крови кислородом;
• поступление одновременно большого количества пациентов в инфекционные больницы лишает возможности оказания необходимой медицинской помощи всем и в полном объеме;
• нет вакцины и медикаментов, доказавших свою эффективность для уничтожения вируса;
• единственный действенный метод остановки пандемии – это социальная изоляция, что ведет к ослаблению экономики.

Новый вид коронавируса: его основные характеристики, с каким именно столкнулись в России

Новый вид коронавируса, который вызывал быстрое распространение респираторного заболевания, относятся к бета-коронавирусам. Он похож на шарик с булавовидными отростками, и такой внешний вид придает ему сходство с астрономической короной солнца. Основные характеристики:

• содержит РНК (рибонуклеиновую кислоту), состоящую из 30 тысяч нуклеотидов;
• размер 50-200 нанометров;
• имеет белковую и липидную (жировую) оболочку;
• длительно сохраняется при низкой температуре и на гладких поверхностях (металл, пластик) – не менее 3-5 суток;
• быстро (за 0,5-2 минуты) уничтожается мыльным раствором, 60% спиртом, перекисью водорода, ультрафиолетовыми лучами;
• оптимальные условия для выживания – температура 5-8 градусов, 30-50% влажность.

Виды передачи

Установлено несколько видов передачи:

• воздушно-капельный,
• контактный,
• фекально-оральный.

Источник заражения – больной человек, он выделяет вирусы при кашле, чихании, разговоре, а также с мочой и калом. Заразиться можно при близком контакте, а также при попадании коронавируса с любым видом биоматериала (чаще с каплями слюны) на поверхности. Здоровый человек при прикосновении рукой к такому объекту вносит инфекцию через слизистую глаз, носа или рта, когда даже неосознанно касается их.

Виды мутаций для распространения

Для нового вида коронавируса типична достаточно необычная способность к распространению, он более заразен, чем его предшественники. Вирусологи выдвигают ряд теорий, которые объясняют такие аномальные свойства. Обнаружено, что в части генетического кода (регулирующая зона) есть последовательность генов, очень сильно отличающаяся от генотипа летучей мыши.

Эта часть не нужна для образования новых вирусных белков, а предназначена для того, чтобы не мешать изменениям РНК коронавируса. То есть, когда новая копия сильно отличается от оригинала, это никак не «пресекается», образно говоря, коронавирус не хочет работать над генетическими ошибками и размножается «как попало», лишь бы побыстрее.

Это вид пневмонии или гриппа

Коронавирус SARS-CoV-2 вызывает заболевание, названное COVID-19, оно имеет несколько видов (вариантов) течения:

• острое респираторное заболевание (легкая форма), похожее по симптомам на грипп (гриппозную инфекцию вызывают другие вирусы);
• пневмония без угрозы для жизни (средней степени тяжести);
• пневмония осложненного течения (с дистресс-синдромом, дыхательной недостаточностью, септическим шоком);
• желудочно-кишечное расстройство.

Высказано предположение, что в зависимости от вида штамма коронавируса, заболевание COVID-19 может протекать преимущественно в легкой или тяжелой форме. У 80% людей коронавирусная инфекция напоминает простуду, за неделю симптоматика (температура, кашель, заложенность носа) уменьшается, остальные переносят пневмонию, у 15% она имеет осложнения.

Смертность составляет в среднем 5,85%, но ученые эпидемиологи больше склоняются к снижению этого показателя до 0,125% из-за огромного числа не выявленных (скрытых) случаев заражения.

Виды лечения

Основные виды лечения коронавируса:

• медикаменты – нет препаратов с подтвержденной эффективностью, уничтожающих возбудитель, в рамках эксперимента используют Плаквенил, Рибавирин, Калетра, Интерферон, Ремдесевир, Фавипиравир, Арбидол, антибиотики при вторичной бактериальной инфекции;
• обеспечение кислородом – искусственная вентиляция легких, аппаратное насыщение венозной крови (экстракорпоральная мембранная оксигенация, ЭКМО);
• капельницы с растворами;
• симптоматические средства – Парацетамол при температуре, Стоптуссин, Амброксол при кашле, бронхорасширяющие (Вентолин, Беродуал).

Новые нестандартные подходы к лечению включают:

• переливание донорской плазмы крови от переболевших;
• введение искусственно созданных антител (моноклональных), их разрабатывают и испытывают сразу несколько крупных фармкомпаний;
• экспериментальная терапия стволовыми клетками, полученными из плаценты.

Эпидемиология, причины

Распространение коронавирусной инфекции происходит практически по всему Земному шару и в любое время года. Пики заболеваемости идентифицируются в зимне-весенний период. Дети болеют чаще взрослых, примерно в 5-7 раз, что в сочетании с пиковыми периодами болезней, обусловленных данными вирусами, отображают один из основных факторов заболеваемости – снижение реактивности иммунной системы. Почему так? Это связано с не до конца сформировавшимся у детей иммунитетом, частом переохлаждении детского организма и неполноценном поступлении должного количества витаминов и макро- микроэлементов, т.к. свежих фруктов и других растительных источников полезных элементов зимой на прилавках магазинов крайне мало.

Источники инфекции, т.е. резервуар Coronaviridae – больные, у которых присутствует острая или стертая форма болезни.

Если говорить о статистике распространенности коронавирусов, как виновников ОРВИ, то этот показатель составляет от 6,8 до 28,6% (пики) всех случаев, в среднем – около 12,4%. И потому, наличие симптоматики, схожей с гриппом не всегда свидетельствует об инфицировании организма именно вирусом гриппа – это могут быть и коронавирусы, и другие виды вирусных инфекций.

Заражение коронавирусом происходит следующими путями:

Воздушно-капельный (аэрогенный) – переносится с потоками воздуха, особенно вблизи чихающего или кашляющего носителя инфекции.

Фекально-оральный путь (алиментарный) – инфекция выделяется во внешнюю среду из ЖКТ, после чего вновь попадает в органы пищеварения через загрязненную воду или продукты питания.

Контактно-бытовой – инфекция попадает на кожу или слизистые, и в случае наличие микротравм, особенно при ослабленном иммунитете проникает в организм, где начинает успешно реплицироваться. Так, инфицирование может произойти и при использовании с больным одной посуды, предметов личной гигиены, или же просто, через рукопожатие, после чего здоровый человек нечаянно почешет глаз, вытрет рукой губы и т.д.

В группу риска входят:

• Медперсонал;
• Дети;
• Лица, часто находящиеся в местах большого скопления людей в зимне-весенний период;
• Лица, проживающие в плохих санитарных условиях;
• Люди с иммуносупрессией — при наличии хронических инфекциях (ВИЧ-инфекция и пр.)
• Лица, употребляющие в пищу экзотические виды животных – мышей (в т.ч. летучих), крыс, змей, собак, хорьковых барсуков и прочие.

Этиология

CoV – это вирусы с положительной цепью РНК, имеющие вид короны под электронным микроскопом (коронам – латинский термин, обозначающий корону) из-за присутствия гликопротеинов-шипов на оболочке. 

Подсемейство Orthocoronavirinae семейства Coronaviridae (отряд Nidovirales) подразделяется на четыре рода CoV: 

• альфакоронавирус (alphaCoV);
• бета-коронавирус (betaCoV);
• дельтакоронавирус (deltaCoV);
• гаммакоронавирус (gammaCoV). 

Кроме того, род betaCoV делится на пять подродов или линий. Геномная характеристика показала, что, вероятно, источники генов alphaCoVs и betaCoVs – летучие мыши и грызуны. Напротив, по-видимому, источники генов deltaCoVs и gammaCoVs – птицы.

Члены этого семейства вирусов вызывают респираторные, печеночные, неврологические и кишечные заболевания у животных, например верблюдов, КРС, летучих мышей, кошек. Сегодня идентифицировано семь человеческих CoV (HCoV), способных инфицировать людей. Некоторые из HCoV были идентифицированы в середине 1960-х годов, тогда как другие – в последние годы.

В целом, результаты исследований показывают, что 2% населения – здоровые носители CoV, и что эти вирусы являются причиной примерно от 5% до 10% острых респираторных инфекций.

Общие человеческие CoVs: 

• HCoV-OC43, HCoV-HKU1 (betaCoVs линии A); 
• HCoV-229E, HCoV-NL63 (alphaCoVs).

У иммунокомпетентных людей они могут вызывать простуду и самоограниченные инфекции ВДП. У лиц с ослабленным иммунитетом и пожилых людей могут возникать инфекции НДП.

Другие CoV у людей:

• SARS-CoV;
• SARS-CoV-2;
• MERS-CoV (бетаCoV линии B и C соответственно). 

Они вызывают эпидемии различной клинической степени тяжести с респираторными и экстрареспираторными проявлениями. При SARS-CoV, MERS-CoV, уровень смертности составляет до 10% и 35% соответственно.

SARS-CoV-2 входит в категорию betaCoVs. Вирус варьируется в нескольких вариантах форм – круглой, эллиптической, плеоморфной, и имеет диаметр примерно 60–140 нм. Он чувствителен к ультрафиолету и теплу. Хотя высокая температура снижает репликацию любого вида вируса, в настоящее время температура инактивации SARS-CoV-2 до сих пор не определена. По многим данным, этот вирус можно инактивировать примерно при 27  C. Напротив, он может сопротивляться холоду даже ниже 0  C. 

Эти типы вирусов можно инактивировать липидными растворителями – эфиром (75%), этанолом, хлорсодержащими препаратами, пероксиуксусной кислотой,  хлороформом, исключая хлоргексидин.

С генетической точки зрения, доказано, что геном нового HCoV, выделенного из кластера пациента с атипичной пневмонией после посещения Ухани, имел 89% нуклеотидную идентичность с SARS-подобным CoVZXC21 летучих мышей и 82% с геном SARS-CoV человека. Из-за этого новый вирус получил название SARS-CoV-2. Его геном с одноцепочечной РНК содержит 29891 нуклеотид, кодируя 9860 аминокислот. 

Хотя происхождение SARS-CoV-2 до конца не изучено, геномный анализ предполагает, что SARS-CoV-2, все-таки, произошел от штамма, выявленного у летучих мышей. Геномное сравнение последовательности SARS-CoV2 человека и известных коронавирусов животных действительно показало высокое сходство (96%) между SARS-CoV2 и betaCoV RaTG13 летучих мышей (Rhinolophus affinis).

Таблица «Структура семейства коронавирусов»

На сегодня наиболее опасными для человека считаются три штамма Coronaviridae:

• SARS-CoV-1 (в конце 2002 вызвал эпидемию ТОРС);
• MERS-CoV (в 2012 году вызвал всплеск респираторного синдрома Среднего Востока);
• SARS-CoV-2 (в конце 2019 года вызвал COVID-19) .

Вплоть до 2002 года эпидемиология определяла коронавирусы как сравнительно безопасные для человека – которые не вызывают тяжелых заболеваний, а если летальные исходы на фоне заражения и случаются, то крайне редко. Но в 2002 году человечество узнало о существовании SARS-CoV-1 – возбудителе атипичной пневмонии. Данный вирус является представителем рода Betacoronavirus, а его главные переносчики – летучие мыши, верблюды и гималайские циветты (виверры). За период эпидемии было зафиксировано свыше 8000 случаев заражения SARS-CoV-1, в том числе 774 – летальных. Но начиная с 2004 года, ни одного факта атипичной пневмонии, вызванной данным вирусом, не фиксировали .

Коронавирус MERS (MERS-CoV), также из рода Betacoronavirus, вирусологи обнаружили в 2012 году. Его природный источник – верблюды. Большинство случаев заражения (82%) были зафиксированы в Саудовской Аравии. Начиная с 2012 года, инфекция поразила около 2,5 тыс. человек. На сегодня вирус все еще продолжает циркулировать в мире, вызывая новые случаи заболевания .

Новый коронавирус SARS-CoV-2, который спровоцировал пандемию 2019-2020 гг., как и два предыдущих, является представителем Beta-CoV B. Специалисты предполагают, что это рекомбинантный (гибридный) вирус, основой для которого послужили два вида коронавируса: летучих мышей и другой, пока неизвестный по происхождению. Генетически возбудитель COVID-2019 как минимум на 70% имеет схожесть с SARS-CoV-1 .

Диагностика коронавирусной инфекции

Клинический анализ крови выявляет реакции иммунитета. При коронавирусной инфекции наблюдаются признаки стандартного вирусного заболевания: снижение уровня лейкоцитов (вплоть до абсолютной лейкопении) или нормальный размер эритроцитов, снижение уровня нейтрофилов, эозинофилов и тромбоцитов, увеличение числа лимфоцитов и моноцитов.

Общий анализ мочи, как правило, без изменений. При развитии тяжёлых форм заболевания наблюдается протеинурия и цилиндрурия (появление в моче белка и цилиндров).

Биохимический анализ крови оценивает функциональную активность органов. Возможно повышение АЛТ, АСТ, С-реактивного белка, креатинина, провоспалительных цитокинов, молочной кислоты и прокальцитонина — маркера сепсиса (прогностически указывает на неблагоприятное течение заболевания).

РИФ — реакция иммунофлюоресценции на выявление антигена. Материалом для исследования служат мазки-отпечатки слизистой носа или отделяемого носоглотки, которые берутся с помощью специального стерильного тампона.

ИФА — иммуноферментный анализ на выявление специфических антител (IgM и IgG). Для исследования кровь из вены берётся дважды с интервалом в 10-14 дней.

Интерпретация результатов теста:

• отрицательны оба класса антител — вероятнее всего, человек пока не болел коронавирусной инфекцией, но может заболеть (нужны повторные тесты);
• положительны только IgM — в настоящий момент пациент переносит острую инфекцию;
• положительны оба класса антител — человек болеет уже длительное время;
• положительны только IgG — обследуемый переболел давно и имеет иммунитет.

Ставить утвердительный диагноз только на основании результатов ИФА не стоит.

ПЦР диагностика позволяет определить тип вируса с помощью выявления РНК. В случае с SARS-CoV-2 материал для диагностики (мазок) берётся из полости носа и ротоглотки, реже используется кровь, моча и фекалии. Результаты теста будут известны через 3-4 часа .

Оценивать результаты ПЦР следует совместно с ИФА:

• если ПЦР положительна, то с высокой вероятностью в настоящий момент человек переносит заболевание (нужен карантин);
• если ПЦР отрицательна и при этом выявлены антитела IgM и IgG (или только IgG), то можно говорить о перенесённом ранее заболевании и отсутствии эпидемиологической опасности (не нужен карантин).

Иногда контрольная ПЦР после получения отрицательного результата ПЦР в подтверждённом ранее случае коронавирусной инфекции показывает положительный результат. Это возможно в небольшом количестве случаев: когда в организме действительно присутствуют вирусные частицы, причём их концентрация будет намного меньше предыдущей (когда человек был в разгаре болезни), либо когда тест-система реагирует на нежизнеспособный вирус. Такие люди, вероятнее всего, не представляют явной опасности для окружающих, но для однозначных выводов пока недостаточно данных.

Культивирование вируса на культуре клеток мышей — выделение вируса в специализированных лабораториях.

Рентгенологическое исследование позволяет обнаружить инфильтраты в лёгочной ткани при пневмонии, например по типу «матового стекла».

Компьютерная томография также может выявить пневмонические изменения, в т. ч. на начальных этапах .

Медицинское обследование на новый коронавирус SARS-CoV-2 обязательно должны пройти люди, которые прибыли из неблагополучных по заболеванию районов, контактировали с больными или имеют симптомы ОРЗ. Это можно сделать в аккредитованной поликлинике по месту жительства.

Дифференциальная диагностика

Никаких специфичных симптомов, отличающих коронавирусную инфекцию от других ОРЗ, не существует. Значение имеет лишь совокупность симптомов с эпидемиологической ситуации по коронавирусной инфекции в регионе, фактом контакта с больными людьми и посещением страны, неблагополучной по данному заболеванию.

Лечение коронавирусной инфекции

Никакого специфического лечения коронавирусной инфекции на сегодняшний день не существует. Попытки использования противовирусных средств в большинстве случаев несут больше вреда нежели пользы. Эти препараты обладают побочными эффектами: обостряют хронические болезни, приводят к патологии крови и т. д. Такое «лечение» может погубить человека и без коронавируса.

20 ноября ВОЗ выпустила рекомендации, в которых не рекомендует применять ремдесивир, независимо от тяжести заболевания, так как в настоящее время нет доказательств эффективности препарата . Однако уточняющие испытания ещё продолжаются .

Лопинавир, и другие ингибиторы ВИЧ, которые используются для антиретровирусной терапии при ВИЧ-инфекции, показали некоторое действие в борьбе с коронавирусом в пробирке, но при испытании на людях оказались неэффективны и опасны (обладают серьёзными побочными эффектами в тех дозах, которые необходимы для минимального влияния на вирусные частицы). В стандартных случаях эти препараты не используются — их применение возможно только в условиях испытаний и строго под контролем врача

На данный момент препараты для лечения ВИЧ-инфекции, а также хлорохин и гидроксихлорохин, ивермектин в мировой практике при лечении коронавируса, в т. ч. тяжёлых форм заболевания, признаны неэффективными и не рекомендуются .

Большинство случаев течения коронавирусной инфекции не нуждается в какой-либо медикаментозной терапии. Больным лёгкими и среднетяжёлыми формами болезни (в т. ч. и новой COVID-19) требуется лишь в покой (домашний режим без выхода на улицу минимум на 7 дней), отдых, рациональное питание (не переедать, не заставлять себя есть через силу) и обильное тёплое питьё (вода, морс, компоты). Воздух в помещении спальни, где находится больной, должен быть умеренно прохладным (18-20°С) и влажным (40-60 %). Это позволяет не пересушивать слизистую респираторного тракта, сохраняя её иммунологическую и очищающую функции. При наличии кашля применяются отхаркивающие и разжижающие мокроту средства, при першении в горле — полоскания и орошения растворами антисептиков.

При тяжёлых формах болезни (в основном COVID-19) и потенциально высоком риске осложнений (у пожилых людей с сопутствующими заболеваниями, иммунодефицитных больных и людей с сахарным диабетом, онкологией, сердечно-сосудистой и бронхолёгочной патологией) показана госпитализация в инфекционный стационар, оснащённый аппаратами искусственной вентиляции лёгких и средствами неотложной терапии. При развитии сопутствующей бактериальной пневмонии или других осложнений показано назначение антибиотиков (при коронавирусной инфекции без бактериальных осложнений применение антибиотиков бессмысленно — они никак не воздействуют на вирус). В безвыходной ситуации при угрозе неблагоприятного исхода в условиях реанимации возможно назначение средств, не имеющих достаточную доказательную базу, например некоторых препаратов для лечения малярии и перспективных противовирусных средств общевирусного спектра .

В виду повышенного риска тромбообразования при новой коронавирусной инфекции госпитализированным пациентам (у которых проводились исследования гемостаза) и больным коронавирусной инфекцией с хроническими заболеваниями сердечно-сосудистой системы показано назначение антитромботической терапии (или продолжение её приёма). У негоспитализированных лиц, у больных нетяжёлыми формами новой коронавирусной инфекции и у лиц без сопутствующей патологии (у которых не проводилось исследование гемостаза) назначение такой терапии не рекомендуется и может быть опасно. Предупреждение и лечение тромбооборазования и кровотечений имеет очень тонкую грань и в порыве помочь можно только навредить .

Применение ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента, блокаторов рецепторов ангиотензина, статинов показано лишь тем людям, которые принимали их до болезни COVID-19, для лечения коронавирусной инфекции они не рекомендованы.

НПВС назначаются согласно общим основаниям их применения, приём кортикостероидов ограничивается лишь тяжёлыми случаями в реанимации или при сопутствующих показаниях . В настоящее время проводятся исследования эффективности и целесообразности применения плазмы выздоравливающих.